La imputación a Mario Montoya Uribe es a título de: determinador con carácter doloso. Los delitos homicidio agravado en concurso homogéneo y sucesivo. Las víctimas 104 personas entre las que se encuentran 5 menores de edad. Esta imputación la hace la Fiscalía tercera delegada ante la Corte Suprema de Justicia.
Estos hechos ocurrieron entre noviembre de 2007 y noviembre de 2008 cuando el General Mario Montoya Uribe se desempeñó como comandante del Ejército Nacional, se refieren los hechos al asesinato de civiles para reportarlos por algunos integrantes del Ejército Nacional como resultados operacionales exitosos, conocidos por la opinión pública como “falsos positivos o ejecuciones extrajudiciales”
Ante las denuncias presentadas contra Montoya el 06 de junio de 2007 el Ministro de Defensa emitió la Directiva, una “reiteración de obligaciones para que las autoridades encargadas de hacer cumplir la ley evitaran los homicidios en persona protegida”, mediante la cual fue creado del comité de seguimiento a denuncias sobre casos de presuntos homicidios en persona protegida.
El 20 de noviembre de 2007 el Comandante General de las Fuerzas Militares emitió la Directiva 300-28 en la que ordenó a todas sus unidades subalternas, incluyendo el Ejército Nacional, privilegiar como medición de los resultados operacionales las desmovilizaciones colectivas e individuales sobre las capturas y estas sobre las muertes en combate, es decir, ordenó cambiar las prioridades operacionales.
Pero el entonces general del Ejército Mario Montoya Uribe desobedeció estas órdenes y siguió evaluando a los Comandantes de todos los niveles del mando por la cantidad de muertes en combate reportadas.
Además, Mario Montoya, según la imputación que le hará la Fiscalía por falsos positivos, destruyó material de prueba.